Jake Dixon conquista la pole sul circuito di Aragon all'ultimo giro col crono di 1'51''636. Il pilota britannico del team CFMoto Inde Aspar non centrava questo risultato dal GP dell'India nella scorsa stagione. Scalzato per una manciata di centesimi il brasiliano Moreira, l'alfiere del team Italtrans partirà dalla 2ª casella in griglia di partenza. Chiude 3° in prima fila a poco più di un decimo dalla pole lo spagnolo Canet per il team Fantic.
Quarto tempo e seconda fila per il turco Oncu del team KTM Ajo, seguito dal primo degli italiani Tony Arbolino, l'alfiere del team Marc VDS chiude 5° in qualifica dopo un passaggio dalla Q1. Albert Arenas del team QJMOTOR Gresini centra il sesto crono ma la sanzione lo vedrà partire dalla 9ª casella. Prestazione forse sotto le aspettative invece per Alonso Lopez, lo spagnolo chiude le qualifiche col 7°crono dopo aver dominato le precedenti sessioni, sua anche la prima Boscoscuro nei riferimenti cronometrici. Lo statunitense Joe Roberts del team Onlyfans, 3° in classifica di campionato, conclude le proprie qualifiche 8° ma partirà 7° a seguito della sanzione di Arenas. L'italiano Celestino Vietti del team KTM Ajo, che il prossimo anno cambierà colori salendo su una Boscoscuro e condividendo il box con Alonso Lopez, centra il 9° tempo, partirà quindi 8°, mentre chiude la top ten l'altro alfiere del team QJMOTOR Gresini, Manuel Gonzalez. Fuori dalla top ten Aldeguer 11°.
Le temperature in rialzo sul circuito spagnolo riservano sorprese nel sabato di qualifiche della classe intermedia. Assenti nelle parti alte della classifica i due principali contendenti al titolo ed alfieri del team MT Helmets, Ogura e Garcia. Ogura, ufficializzato il prossimo anno in classe regina col team Trackhouse, affronta con successo la Q1, ma non va oltre il 16° tempo. Giornata da dimenticare invece per il leader del campionato Sergio Garcia, protagonista nella Q1 di un highside senza conseguenze per il pilota, partirà 29° nelle retrovie. Highside senza conseguenze anche per Masia.
Diverse anche le sanzioni che si rifletteranno sulla griglia di partenza: per essere stati lenti in traiettoria nella prima sessione di libere, l'italiano Foggia, Arenas, Salac ed Escrig dovranno cedere tre posizioni in griglia.